我校吴巧凤/余曙光研究团队在针灸多组学异源数据融合分析平台建设方面取得阶段性进展
近年来,针灸组学、动物实验及临床研究数据井喷式发展,将多种组学数据与所匹配的临床效应指标或动物实验数据进行异源、多层次融合式分析,成为从新的维度揭示针灸作用机制和系统阐释针灸作用特征和规律的重要研究方向。吴巧凤/余曙光研究团队将前期在针灸研究领域所获得的基因组、转录组、蛋白及蛋白修饰组、宏基因组、代谢组等高通量数据,与所获得的实验室指标进行整合,并结合国内外相关公共数据库和文献报道,搭建了ACU&MOX-DATA数据分析平台。团队主要牵头负责人、针灸推拿学院科研实验中心主任吴巧凤教授介绍:“该平台的典型特点是在中医理论指导下,对针灸研究所获得的各种观测指标,通过异源、多层次数据融合分析的方法,实现对针灸学领域关键科学问题的集成分析和可视化解读。”
该平台构建了两个关键网络界面:一是腧穴功效探索界面,研究者可基于网站已有数据,选择不同的疾病、腧穴、干预方式参数(如针/灸、针刺频率等)和靶器官,综合分析上述因素对腧穴功效的影响;二是针灸作用特点及机制分析界面,研究者可选择不同刺激参数下,或不同动物模型中,针灸干预造成的主要差异基因或共同影响的共变基因,并分析其相关富集途径。
ACU&MOX-DATA数据分析平台是目前国内外针灸领域首个针对针灸多组学数据、临床效应指标和动物实验数据进行多层次、异源数据融合分析的在线共享分析平台,目前已经完成前期部分组学数据的整合分析。
据悉,我校创新研究院陈伟教授团队参与了网站平台的建设;四川大学华西医院朱冰梅教授团队、天津中医药大学郭永明教授团队等为网站建设提供了支持和帮助。清华大学蓝勋教授、中国科学院数学与系统科学研究院王勇研究员提供了技术协助。
该平台建设获得了国家重点研发计划(No.2019YFC1709001),国家中管局多学科交叉创新团队(No.ZYYCXTD-D-202003)和成都中医药大学杏林青年创新团队项目(QNTD2022003)的资助。
吴巧凤教授说道:“团队计划下一步将与公共数据库对接,完善用户个性化数据上传途径,进一步解决临床或实验室检测指标与多组学数据整合的技术瓶颈。该平台有望成为大数据时代下针灸发展的重要支撑,进一步促进针灸学的创新发展,提升学科发展的影响力。
图 ACU&MOX-DATA数据网站平台主页面
针灸多组学异源数据融合分析平台——ACU&MOX-DATA网址:
(http://cbcb.www.yoyuju.com/ACU&MOX-DATA/)
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