中医临床基础学科包含“伤寒”、“金匮”、“温病”，由邓绍先、何伯埙、邹仲彝、刘述机、宋鹭冰等全国知名中医专家开创，邓绍先、何伯埙被世人誉为“邓伤寒”“何温证”，后在彭履祥、戴佛延、王廷富、李克光、陈治恒、张之文、张家礼等老一辈专家带领下，历经60余年的发展，学科在经典研究方面成果丰硕，在全国中医经典学术界占据重要的学术地位，在全国较早举办多期师资培训班，为全国中医药界培养了一批学术带头人。学科是全国中医药院校最早的硕、博士授权点之一，首批中医学博士后科研流动站。

中医临床基础学科为四川省重点学科，温病学、金匮要略分别为国家中医药管理局“十一五”、“十二五”重点学科。学科为中华中医药学会副会长单位、中国中医药研究促进会温病分会会长单位、四川省中医药学会仲景、温病主任委员单位。温病学为教育部中医类教学指导委员会课程联盟理事长单位、金匮要略为课程联盟副理事长单位。建设有省级教学团队，省级精品课程、省精品资源共享课程，《温病学》《金匮要略》为省级一流课程。学科教材研究成果丰硕，为全国统编教材1-2版《伤寒论》、4-5版《金匮要略》、2-5版《温病学》主编和参编单位，为“十二五”“十三五”“十四五”本科和研究生多层次《温病学》《金匮要略》主编单位。同时主编全国首套中医师承系列教材，主编中医药高级丛书《温病学》和《金匮要略》。主编的“十三五”规划教材《温病学》获教育部首届优秀教材二等奖、获人民卫生出版社首届教材融合奖。

坚持“强化经典理论，重视临床应用，培养学生中医思维和临床能力”的教学理念，深入开展经典“悟用融通”的系列教学研究与改革，推动强化临床运用的课程体系改革，全国较早开设《瘟疫学》《伤寒论学用指要》《金匮辩证法与临床》等经典临床课程。先后承担了省级和校级教学改革项目50余项，发表教学改革论文40余篇，获四川省教学成果一等奖2项，二等奖4项。学科承担国家重点研发计划、国家973计划、国家科技重大专项、国家自然科学基金等课题80余项，近五年发表学术论文300余篇，出版著作20余部，获四川省科技进步奖，中华中医药学会科学技术奖等多项。学科建有四川省巴蜀伤寒流派和温病流派工作室，历来重视传承工作，主编《中医四部经典解读》《川派中医药源流与发展》、《川派中医药名家系列丛书·陈治恒》《川派中医药名家系列丛书·宋鹭冰》等。学科专家积极参与新发突发传染病防治，从60年代钩体病到近年非典、人猪链球菌病、新冠肺炎等，做出了重要贡献。

学科先后有首届全国名中医1人，全国老中医药专家学术经验继承工作指导老师4人，四川省优秀教育工作者1人，四川省教学名师1人，四川省名中医4人，四川省学术和技术带头人4人，四川省学术和技术后备人选4人；博士研究生导师5人，硕士研究生导师12人。学科现有教师18人，其中教授4人，副教授7人，已形成以中青年为主体、老中青相结合的高层次、高水平团队。

主要研究方向：

1.《伤寒论》六经证治规律研究

2.张仲景辨证论治体系及临床运用研究

3.温病经典理论与感染性疾病防治研究